好氧生物處理法只能去除廢水中的部分易降解的有機物，而厭氧生物法可用于處理高濃度有機廢水，也可用于處理中、低濃度有機廢水，對染料中的偶氮基、蒽醌基和三苯甲烷基均可降解。楊波等應用自主研制的強化循環厭氧反應器中試規模處理實際印染廢水，在進水COD濃度1000-3650mg/L、系統容積負荷0.7-6.4kg/(m3·d)條件下，廢水COD和色度平均去除率分別達到55%和73%。Somasiri等采用升流式厭氧污泥床反應器對紡織廢水進行脫色，能夠去除超過90%的COD，超過92%的色度被脫除。厭氧好氧組合處理工藝，能在一定程度上彌補處理工藝的不足。盧江濤采用厭氧水解-好氧-硅藻土吸附工藝對某印染廢進行處理實驗，結果表明：COD總去除率達87.6%，色度總去除率達98%，出水水質達到了《紡織染整工業水污染物排放標準》一級排放標準要求。具體聯系污水寶或參見http://www.jianfeilema.cn更多相關技術文檔。

　　生物強化技術：由于傳統的生物處理法對特殊染料或污染物的去除往往不夠理想，國內外許多學者也致力于培育或改良高降解活性菌種，用于印染廢水處理，產生了生物強化技術。即向廢水處理系統中投加自然界中的優勢菌種或通過基因組合技術產生的高效菌種，增強生物量，強化生物量的反應，以去除某一種或某一類有害物質為目的。目前，生物強化技術最普遍的應用方式是直接投加對目標污染物具有特效降解能力的微生物。傅春堂等從污水處理廠污泥中篩選出能降解3種染料的菌株。通過梯度馴化，優選出1株適應能力強、活力旺盛的菌株F2，發現腐霉菌F2能徹底降解染料。Novotny證實，白粑齒菌能降解很多偶氮、蒽醌、噻嗪、三苯甲烷和酞菁染料。