地面水常常受到土壤、工業(yè)污水廢水、生活污水及各種雜質(zhì)的污染，促使細(xì)菌滋生，有時(shí)每毫升水中細(xì)菌數(shù)可達(dá)幾萬乃至幾十萬個(gè)在有的水域里，大腸桿菌甚至達(dá)數(shù)萬個(gè)以房。雖然在水處理的過程中，經(jīng)過混凝、沉淀(或澄清)、過濾等的凈化過程，粘附在懸浮物上的大部分細(xì)菌、大腸肝菌、屆原菌和其他二些微生物也一同被除去。但是，并不徹底，還存在一定量的對(duì)人體有害的微生物。

        為了保障人民的健康，防止疾病的傳播，還必須進(jìn)行水的消毒，以殺滅水中的病毒。我國(guó)“生活飲用水衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)”中規(guī)定，在37℃培養(yǎng)24H的水樣中，細(xì)菌總數(shù)不超過100個(gè)／ml，大腸菌群每升水中不超過3個(gè)。為此在混凝澄清過濾之后還需進(jìn)行消毒。在工業(yè)冷卻水處理中，為了防止循環(huán)水不產(chǎn)生生物粘泥，要控制循環(huán)水中的異養(yǎng)菌數(shù)不超過500000個(gè)／mL，因此，對(duì)于作為循環(huán)水系統(tǒng)補(bǔ)充水的過濾水，亦需要進(jìn)行消毒殺菌處。在除鹽水處理系統(tǒng)，為了防止離子交換樹脂受到細(xì)菌的污染，也需要對(duì)其原水進(jìn)行消毒殺菌。此外，消毒還可以除去水的色度。