pH下降的原因有兩個，一是進水堿度不高。二是進水碳源不足，無法補充硝化消耗的一半的堿度。隨著NH3-N被轉化成NO3—-N，會產生部分礦化酸度H+，這部分酸度將消耗部分堿度，每克NH3-N轉化成NO3—-N約消耗7.14g堿度(以CaC03計)。因而當污水中的堿度不足而TKN負荷又較高時，便會耗盡污水中的堿度，使混合液中的pH值降低至7.0以下，使硝化速率降低或受到抑制。當酸堿度下降時應及時補充堿液來調節酸堿度。