①化能異養型代謝：在廢水生物處理中最主要的代謝形式，主要用于對廢水中有機物的去除，包括主要的好氧細菌和厭氧細菌；

②化能自養型代謝：也是廢水生物處理中常見的一種代謝形式，主要包括硝化細菌（將氨氮氧化為亞硝酸鹽，或進一步氧化為硝酸鹽）、氫細菌（對其的應用還處在研究階段）、鐵細菌等；

③光合異養型代謝：利用光合細菌以高濃度有機廢水為基質生產菌體蛋白；

④光合自養型代謝：在廢水生物處理中少有應用。