北京市環境保護科學研究院是全國第一家從事環境保護的科研機構。她的前身是1957年成立的建工部市政研究所，1973年改名為北京市環境保護科學研究所，1994年正式改為北京市環境保護科學研究院。 北京市環科院現有職工200余人。其中，研究員及教授級高級工程師6人、副研究員及高級工程師50人、享受國務院政府津貼16人，獲國家級、市級突出貢獻專家8人。 作為我國首批有權授予環境工程碩士學位的單位，歷年來北京市環科院已培養碩士研究生100余人。 北京市環科院下設：水與生態環境研究所、大氣污染防治研究所、固廢污染防治研究所、環境政策與規劃標準研究所、環境工程設計所、環境技術咨詢所、北京市環科環境工程設計所。 以北京市環科院為依托單位的工程中心有：國家城市環境污染控制工程技術研究中心（國家科技部）、國家環境保護工業廢水污染控制工程技術（北京）中心（國家環境部）、北京水環境技術與設備研究中心（北京市科委）。 北京市環科院所屬的“北京市環科環境工程設計所”，具有市政行業排水工程專業甲級設計資質、水污染防治工程專項甲級設計資質、固體廢物處理處置工程專項乙級設計資質。北京市環科院還具有國家環境影響評價工程咨詢甲級資格證書、環境污染治理設施運營（生活污水、工業廢水）甲級資質，以及國家發改委頒發的工程咨詢甲級資質證書。
北京市環境保護科學研究院位于北京市西城區北營房中街59號，是一家專注于環境保護的高新技術企業。作為專業的環保公司，始終以中國的環境保護事業為己任，竭誠致力于環保服務事業，綜合實力在全省同類型企業名列前茅。北京市環境保護科學研究院成立以來，已經取得國家環保部頒發的污染治理設施運營資質證書，具體為：2011年獲得生活污水甲級資質，有效期為2014年09月；2011年獲得工業廢水甲級資質，有效期為2014年09月；2007年獲得工業廢水甲級、生活污水甲級資質，有效期為2011年01月。